هاجمت الشاعرة فاطمة ناعوت المهندس عبد المنعم الشحات ـ المتحدث الرسمى للدعوة السلفية ـ كما شنت هجومًا حادًا على التيار الإسلامى الذى وصفته بالإقصائى، وطالبت ناعوت بسحب الجنسية المصرية عن الشحات قائلة إن الحكومة المصرية كان يجب أن تسقط الجنسية عنه بعد أن وصف الحضارة المصرية بالعفنة.
وقالت ناعوت خلال لقاء فى برنامج ستوديو 27 على الفضائية المصرية إنها ستتقدم ببلاغ ضد الشحات بقتل نجيب محفوظ مشيرة إلى أن محفوظ إذا كان حيًا الآن لقتل بعد التصريح بتكفيره. وزعمت أن الجماعات الإسلامية تشوه الإسلام ومصر وتاريخها مستنكرة تصريحات حازم شومان الذى صرح خلالها أن جامعة القاهرة أنشئت لمحاربة الإسلام موضحة أن مثل هذه التصريحات عندما تصدر من شيخ تعد فتوى للناس.
وكانت فاطمة ناعوت، المدافعة الشرسة عن الكنيسة أثارت جدلاً واسعاً فى تصريحاتها الغريبة والتى تهاجم خلالها الإسلام استرضاءً للكنيسة فقد أشارت خلال ندوة عقدت بالكاتدرائية المرقسية بعنوان مصر إلى أين فى إبريل 2011 إلى سوء التعليم فى مصر مطالبة بإعادة هيكلة التعليم وتنقية مناهج اللغة العربية والنصوص القرآنية حتى لا يساء فهمها وطالبت فى حالة الإبقاء عليها بالاستشهاد بآيات من الإنجيل أسوة بالقرآن الكريم، كما هاجمت فى لقاء مع معتز الدمرداش ببرنامج 90 دقيقة تعاليم الإسلام وامتدحت تعاليم الإنجيل.